MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shewanella baltica OS117 plasmid pSBAL11701

Total Repeats: 2240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017577	ATTA	2	8	42	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017577	CTTAT	2	10	87	96	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017577	CAT	2	6	242	247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343409
4	NC_017577	TAC	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343409
5	NC_017577	ATT	2	6	336	341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343409
6	NC_017577	ATC	2	6	462	467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343409
7	NC_017577	CTG	2	6	501	506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343409
8	NC_017577	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343409
9	NC_017577	ATT	2	6	785	790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343410
10	NC_017577	ATC	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343410
11	NC_017577	TAT	2	6	810	815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343410
12	NC_017577	AATG	2	8	841	848	50 %	25 %	25 %	0 %	386343410
13	NC_017577	AC	3	6	928	933	50 %	0 %	0 %	50 %	386343410
14	NC_017577	CAA	2	6	1083	1088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343410
15	NC_017577	ATT	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343410
16	NC_017577	TGG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343410
17	NC_017577	ATT	2	6	1163	1168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343410
18	NC_017577	ATT	2	6	1184	1189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343410
19	NC_017577	AAC	2	6	1197	1202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017577	AAT	2	6	1215	1220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017577	CAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017577	AAT	2	6	1293	1298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017577	AAAT	2	8	1377	1384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017577	AAC	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017577	TATC	2	8	1417	1424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017577	TAAA	2	8	1437	1444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017577	GA	3	6	1454	1459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017577	GT	3	6	1601	1606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017577	CAAT	2	8	1656	1663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017577	ATG	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017577	ATT	2	6	1743	1748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017577	TG	3	6	1767	1772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017577	T	6	6	1821	1826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017577	GATA	2	8	1840	1847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017577	TCATTT	2	12	1883	1894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386343411
36	NC_017577	TCA	2	6	1919	1924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343411
37	NC_017577	GCC	2	6	2007	2012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343411
38	NC_017577	TTC	3	9	2014	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343411
39	NC_017577	GCC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343411
40	NC_017577	TCC	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343411
41	NC_017577	CAT	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343411
42	NC_017577	CGAG	2	8	2178	2185	25 %	0 %	50 %	25 %	386343411
43	NC_017577	T	6	6	2194	2199	0 %	100 %	0 %	0 %	386343411
44	NC_017577	AAC	2	6	2302	2307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343411
45	NC_017577	T	8	8	2322	2329	0 %	100 %	0 %	0 %	386343411
46	NC_017577	TTGC	2	8	2442	2449	0 %	50 %	25 %	25 %	386343411
47	NC_017577	CTG	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343411
48	NC_017577	A	6	6	2587	2592	100 %	0 %	0 %	0 %	386343411
49	NC_017577	C	6	6	2599	2604	0 %	0 %	0 %	100 %	386343411
50	NC_017577	TGT	2	6	2622	2627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343411
51	NC_017577	AAT	2	6	2635	2640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343411
52	NC_017577	ATG	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343411
53	NC_017577	TG	3	6	2689	2694	0 %	50 %	50 %	0 %	386343411
54	NC_017577	TA	3	6	2715	2720	50 %	50 %	0 %	0 %	386343411
55	NC_017577	CT	3	6	2779	2784	0 %	50 %	0 %	50 %	386343411
56	NC_017577	TTG	2	6	2819	2824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343411
57	NC_017577	T	6	6	2846	2851	0 %	100 %	0 %	0 %	386343411
58	NC_017577	CTT	2	6	2856	2861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343411
59	NC_017577	TGC	2	6	2862	2867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343411
60	NC_017577	CCA	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343411
61	NC_017577	GAAT	2	8	2953	2960	50 %	25 %	25 %	0 %	386343411
62	NC_017577	TCA	3	9	2972	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343411
63	NC_017577	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343411
64	NC_017577	GTGC	2	8	3009	3016	0 %	25 %	50 %	25 %	386343411
65	NC_017577	AT	3	6	3029	3034	50 %	50 %	0 %	0 %	386343411
66	NC_017577	TCA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343411
67	NC_017577	TCA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343411
68	NC_017577	ATA	2	6	3134	3139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343411
69	NC_017577	CAT	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343411
70	NC_017577	AAT	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343411
71	NC_017577	CTT	2	6	3216	3221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343411
72	NC_017577	TCA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343411
73	NC_017577	GTT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343411
74	NC_017577	CGG	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386343411
75	NC_017577	AGTT	2	8	3469	3476	25 %	50 %	25 %	0 %	386343411
76	NC_017577	AAT	2	6	3516	3521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343411
77	NC_017577	TTG	2	6	3639	3644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343411
78	NC_017577	CAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017577	A	6	6	3731	3736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017577	AT	3	6	3743	3748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017577	GAC	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017577	TCAA	2	8	3838	3845	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017577	AAAACA	2	12	3867	3878	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386343412
84	NC_017577	AATG	2	8	4034	4041	50 %	25 %	25 %	0 %	386343412
85	NC_017577	GAA	2	6	4065	4070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343412
86	NC_017577	A	7	7	4074	4080	100 %	0 %	0 %	0 %	386343412
87	NC_017577	TGGTGT	2	12	4133	4144	0 %	50 %	50 %	0 %	386343412
88	NC_017577	GCA	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343412
89	NC_017577	GGC	2	6	4380	4385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386343412
90	NC_017577	GGT	2	6	4417	4422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343412
91	NC_017577	ATT	2	6	4559	4564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343412
92	NC_017577	AAAC	2	8	4574	4581	75 %	0 %	0 %	25 %	386343412
93	NC_017577	GCC	2	6	4613	4618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343412
94	NC_017577	CAA	2	6	4677	4682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343412
95	NC_017577	TGG	2	6	4799	4804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343413
96	NC_017577	ATG	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343413
97	NC_017577	AGC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343413
98	NC_017577	TGG	2	6	5185	5190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386343413
99	NC_017577	T	7	7	5206	5212	0 %	100 %	0 %	0 %	386343413
100	NC_017577	AAG	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386343413
101	NC_017577	TCA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
102	NC_017577	ACA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386343413
103	NC_017577	ACGA	2	8	5346	5353	50 %	0 %	25 %	25 %	386343413
104	NC_017577	A	6	6	5549	5554	100 %	0 %	0 %	0 %	386343413
105	NC_017577	CAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
106	NC_017577	CGC	2	6	5758	5763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343413
107	NC_017577	ATT	2	6	6095	6100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343413
108	NC_017577	CCCA	2	8	6157	6164	25 %	0 %	0 %	75 %	386343413
109	NC_017577	TCCA	2	8	6186	6193	25 %	25 %	0 %	50 %	386343413
110	NC_017577	CA	3	6	6202	6207	50 %	0 %	0 %	50 %	386343413
111	NC_017577	GAT	2	6	6210	6215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343413
112	NC_017577	TGC	2	6	6220	6225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343413
113	NC_017577	GCC	2	6	6310	6315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343413
114	NC_017577	C	7	7	6314	6320	0 %	0 %	0 %	100 %	386343413
115	NC_017577	CAT	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
116	NC_017577	TAG	2	6	6406	6411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343413
117	NC_017577	CTG	2	6	6452	6457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343413
118	NC_017577	AGC	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343413
119	NC_017577	C	6	6	6587	6592	0 %	0 %	0 %	100 %	386343413
120	NC_017577	GTC	2	6	6675	6680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343413
121	NC_017577	ATTT	2	8	6682	6689	25 %	75 %	0 %	0 %	386343413
122	NC_017577	T	7	7	6687	6693	0 %	100 %	0 %	0 %	386343413
123	NC_017577	CAT	2	6	6790	6795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
124	NC_017577	CAT	2	6	6907	6912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
125	NC_017577	CTT	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386343413
126	NC_017577	ATT	2	6	6977	6982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343413
127	NC_017577	CA	3	6	7009	7014	50 %	0 %	0 %	50 %	386343413
128	NC_017577	CTA	2	6	7081	7086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
129	NC_017577	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343413
130	NC_017577	CGC	2	6	7267	7272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343413
131	NC_017577	TGC	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343413
132	NC_017577	CTG	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343413
133	NC_017577	GTA	2	6	7337	7342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343413
134	NC_017577	ATC	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
135	NC_017577	TC	3	6	7559	7564	0 %	50 %	0 %	50 %	386343413
136	NC_017577	ATT	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343413
137	NC_017577	TAC	2	6	7643	7648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
138	NC_017577	ACC	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343413
139	NC_017577	ATG	2	6	7741	7746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343413
140	NC_017577	TG	4	8	7760	7767	0 %	50 %	50 %	0 %	386343413
141	NC_017577	GTAC	2	8	7937	7944	25 %	25 %	25 %	25 %	386343413
142	NC_017577	T	7	7	8122	8128	0 %	100 %	0 %	0 %	386343413
143	NC_017577	AAT	2	6	8131	8136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343413
144	NC_017577	TG	3	6	8211	8216	0 %	50 %	50 %	0 %	386343413
145	NC_017577	TAA	2	6	8313	8318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386343413
146	NC_017577	CGATT	2	10	8348	8357	20 %	40 %	20 %	20 %	386343413
147	NC_017577	T	6	6	8356	8361	0 %	100 %	0 %	0 %	386343413
148	NC_017577	ATC	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343413
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150	NC_017577	T	6	6	8453	8458	0 %	100 %	0 %	0 %	386343413
151	NC_017577	CCT	2	6	8562	8567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386343413
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153	NC_017577	GAGCA	2	10	8674	8683	40 %	0 %	40 %	20 %	386343413
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155	NC_017577	TCTT	2	8	8781	8788	0 %	75 %	0 %	25 %	386343413
156	NC_017577	AGT	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386343413
157	NC_017577	GTC	2	6	8958	8963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343413
158	NC_017577	A	6	6	8976	8981	100 %	0 %	0 %	0 %	386343413
159	NC_017577	TAAA	2	8	8998	9005	75 %	25 %	0 %	0 %	386343413
160	NC_017577	GCC	2	6	9011	9016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386343413
161	NC_017577	TGT	2	6	9055	9060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386343413
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163	NC_017577	CCA	2	6	9162	9167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386343414
164	NC_017577	GCA	2	6	9192	9197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386343414
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174	NC_017577	ATT	2	6	10065	10070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386343414
175	NC_017577	AC	3	6	10089	10094	50 %	0 %	0 %	50 %	386343414
176	NC_017577	CTG	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386343414
177	NC_017577	TGTT	2	8	10190	10197	0 %	75 %	25 %	0 %	386343415
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255	NC_017577	TA	3	6	14532	14537	50 %	50 %	0 %	0 %	386343417
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261	NC_017577	ATC	2	6	14832	14837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386343417
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500	NC_017577	TAAC	2	8	27225	27232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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